«ЛатРосТранс» является ответственным высокотехнологичным предприятием, деятельность которого характеризуется бережным отношением к окружающей среде. Все сточные воды очищаются в уловителях нефтепродуктов, уловителях мазута и в хранилище отходов нефтепродуктов. До передачи опасных отходов на утилизацию специализированным предприятиям обеспечивается их соответствующее хранение. Осадок, побочные продукты и ил, образующиеся в результате очистки сточных вод, а также содержащие нефтепродукты отходы хранятся на специально оборудованных полигонах отходов.

Герметичность трубопровода непрерывно контролируется системой обнаружения утечек нефтепродуктов, которая осуществляет измерение давления в нефтепроводе через каждые 20 километров. В случае нетипичного изменения давления система позволяет определить координату места повреждения с точностью до 50 метров. Как только поступает соответствующее сообщение, на место происшествия направляется техническая служба и специалисты по безопасности.
Раз в три-четыре года производится детальная проверка технического состояния трубопровода с использованием внутритрубной ультразвуковой или электромагнитной диагностики. Этот метод контроля довольно точно определяет потери металла на внутренней поверхности трубопровода – дефекты, вызванные коррозией, трещины, а также незаконные подключения. Партнеры предприятия при проведении таких проверок выбираются на конкурсной основе путем оценки наиболее подходящих предложений. В 2012 году проверка трубопровода была выполнена совместно с компанией Weatherford, занимающейся нефтепромышленными технологиями.
С 2010 года «ЛатРосТранс» занимается очисткой нефтепровода Полоцк – Вентспилс. Долговременное нахождение сырой нефти в нефункционирующем нефтепроводе может создать повышенный риск коррозии и потенциальной экологической катастрофы, поэтому важно заменить находящуюся в трубопроводе нефть азотом, который намного лучше подходит для консервации трубопровода. После откачки нефти в трубопровод вводится азот – смесь инертного газа, которая является более безопасным и экологически приемлемым заполнителем трубопровода.
В рамках данного проекта на территории перекачивающей станции «Джуксте» сооружены отстойники для химической и биологической очистки сточных вод, образовавшихся после очистки нефтепровода. Очистку сточных вод производит чешское предприятие Limek plus, а качество очистки контролирует опытный латвийский поставщик услуг в сфере охраны окружающей среды «ВентЭко».